La Estación Marítima del muelle nº 3, otorgada a Eurogates Group Terminals, S.L., inicia su concesión el 2 de noviembre de 2016. Es la Estación Marítima destinada al tránsito de pasajeros en régimen de transporte, sus vehículos y su equipaje, como Línea Regular entre Málaga y Melilla y en la actualidad atiende a dos líneas (Trasmediterránea y Balearia). Asimismo, presta aquellos servicios comerciales asociados al pasaje, con locales comerciales dentro de la Estación Marítima. Ocupa un conjunto superficial de 6.500 m², distribuidos entre pasarela, superficie de muelles y edificio en tres plantas.